Boje er uddannet på to kunstskoler – en på Lolland og en i Køben-havn. Herudover dyrker han sine forbilleder i kunstens verden, hvoraf Jens Birkemose har været én af dem, Boje har været i kontakt med. Man kan se på malerierne, at han er velorienteret inden for den amerikanske litterære retning – The Beat Generation, modernistisk maleri såsom Robert Rauschenberg og moderne musik såsom Velvet Underground.
Jens Jørgen Boje havde sin første indlæggelse på et psykiatrisk hospital i 1988, og hans kunst skildrer i høj grad følelsesmæssige op- og nedture.
Museum Ovartaci viste i 2012 en udstilling i tre sale med Jens Jørgen Bojes tegninger. Ligesom den forrige er også denne udstilling kurateret af idéhistoriker og forfatter Lars Morell, der tillige har skrevet udstillingens katalogtekst. Lars Morell lover, at det bliver “en vild og upoleret udstilling, hvor billederne bogstavelig talt vælter ned i hovedet på tilskuerne”.